野炮兵第二十二联队，联队长为三国直福大佐。

工兵第十六联队，联队长为今中武义大佐。

辎重兵第十六联队，联队长为柄泽畔夫中佐。

通信队、卫生队以及第1至第4野战医院。

太平洋战争爆发后，第16师团被编入本间雅晴中将的第14军进攻菲律宾，参加了第一、第二次巴丹半岛攻坚战和镇压菲律宾各岛抗日活动的讨伐战，之后驻屯在菲律宾。

1944年夏秋，为