守备勋臣当然也不是只能管理那点卫所兵，实际上还对“客军”有一定的制约能力，譬如刘显当时镇守狼山，就属于南京直接分管的四川籍客军，他需要仰仗南京方面协调调度、后勤补给等，所以南京守备勋臣在名义上也是他的上级，如果克扣他的补给，他也是很难受的。更甚一步就是像徐鹏举这样，直接向南京兵部告刁状，说他不听调遣、为非作歹等，一般而言南京兵部会给南京守备勋臣这个面子——毕竟人家是上级，也是自己的同僚不是？