本次军机会议最终达成了三项决议，一是确立了对后金以守为主的战略，放弃了短期内收复辽东这项不切实际的计划。

今后的宁远防线，堡垒最多只修到锦州一线，不再向东扩张，孙承宗欲以堡垒战术收复辽东的算盘，可谓是半途而废了。

在座君臣已经预料到，当辽饷从每年五百万两削减至四百万两，辽西将门集团必定煽动兵乱，即将督辽的兵部尚书王在晋，已经感觉到万钧重压在肩上。