在一切尘埃落定，人类因为脑海之中发生的战争而进入了一个相对和平发展的阶段，碇真嗣也在这样一个没有神明的世界，过上了相对平静的生活。

当然只能说是相对平静，被美少女一个过肩摔扔出房间这种事情，还是时有发生的，在战争结束之后，碇真嗣还是和明日香一起住在葛城美里的家里，而两人的近距离相处却总是出现一些意外。

就好比刚刚，两人正在闲聊，碇真嗣却突然