天启七年九月，深秋时节，因翰林院检讨李明睿弹劾当朝司礼监秉笔太监兼提督东厂魏忠贤擅杀幼男幼女，朱由校听闻后龙颜大怒，叱骂魏忠贤畜生耳。

一度权势熏天的魏忠贤因此被革掉司礼监秉笔一职，贬为南京镇守，且被夺掉九千岁称号，各地官员所建生祠也严令立即拆毁。

与此同时，在内阁大学士孙承宗和侍郎徐光启被起复后，王在晋、毕懋康、孙元化、茅元仪等曾应党锢之争而罢职的朝廷文武官员