国是岛国，和欧洲本土隔着一条英吉利海峡，大海能阻隔很多疾病的传播，却不能阻拦从阿姆斯特丹运送棉花的商船，从1663年到1664年阿姆斯特丹一样遭到瘟疫蹂躏，伦敦最先遭殃的是外围码头以及贾尔斯教区，在这两处生活的事贫困的工人阶级，处于社会底层的患者并没有被关注和记录，因此伦敦大瘟疫的首个案例是1665年4月12日确诊的丽贝卡安德鲁斯。

当皇室逃到牛津之后，伦敦市市府参事和其他主要当局官员选