东瀛盛行，多有僧人入宋学习。

后来一发不可收拾，到了明朝时，中医在东瀛形成独特的汉方医学，更有诸多流派，其中以古方派，折衷派，考证派，后世派四大派系流传盛广。

其中折衷派，最为讲究临床经验，主张博采众长，视时效性为第一要义。

其中以汉兰折衷派更为极端，彻底打破了东瀛独尊汉方的惯例，不断吸收西方医学，重新整理本土医学。