配合融洽，直到打下邺城后，有两件事两人发生意见相左。第一件事是有人提议天下恢复古九州，正合曹操之意，荀彧反对，曹操暂时未采纳此议。

第二件事是拿下冀州、并州和部分幽州后，启用或延用了大批冀州、幽州、并州人才，而未全部采纳用荀彧之前培养的豫州、兖州人才北上。

幽州涿郡人李立成为尚书正是第二件事扩展到尚书台。

另外，前将军马腾向朝廷自荐出任雍州刺史，表示定能稳定雍州。