认为应该由同盟会领导革命事业，因此，秦炳最终没能留在共和军里效力，而是跟随谢持等人去了福建，投奔革命建国军。

秦炳并没有在福建军队中呆多久，很快他又跟随上级去了广东，参加了广东的光复工作，但是由于君宪派掌握了广东政权，革命派遭到排挤，秦炳不得不跟随黄兴、宋教仁等人辗转各地，寻求着同盟会的机会，并最终到了广西，并在光复后的广西革命政府中担任过一段时间的军事顾问，后来南北大战爆发，秦炳又跟随