百日维新”失败之后，正在京城的黄乃裳也被捕入狱中，后得友人相助，才得以有惊无险。

此后的黄乃裳在“维新”与“革命”之间彷徨，由于清廷守旧派的反扑，他不得不离开国内，远赴新加坡，投奔女婿，在新加坡做了段日子的报社总编辑，因为主张激进，小有文名，那一年，他五十一岁，也正是在那个时候，“华人殖民”的念头开始让黄乃裳先生走上民间殖民的道路。

经过一番认真的考虑，黄乃裳最终选择了婆罗洲沙