工业的无菌制造工艺、植入体内物品的制造、外科手术、移植手术、集成器的制造、隔离等。

千级洁净室主要用于高质量光学产品的生产，还用于试、装配飞机陀螺仪、高质微型轴承等。

万级洁净室用于液压是被或气压设备的装配，某些情况下也用于食品饮料工业、医工业等。

十万级洁净室多用于工业，比如光学产品制造、微小的元器件制造、电子系统、液压或压气系统的制造、食品饮料的生产、医药工业等。