设巡按以及下设监军道、兵备道、监粮道等各道，为的就是制约总兵，以文驭武，避免总兵拥兵自重。

到了此时的巡抚，基本上已经都兼提督军务，拥有调兵选将练兵的军事指挥大权，巡抚们的职责范围，主要有三，抚循地方，考察属吏，提督军务，即治民、治吏、治军。做为巡抚一面总揽一镇的封疆大吏，巡抚的权柄是极高的。

巡抚除了文武科举、处决重辟、审录冤刑、参拔吏典、纪验功赏这些事务不得干预，全归巡按管