后来，他有推荐吴三桂为都督签事，出任辽东总兵，团练宁远兵马。吴在历史上虽然是个大汉奸，可却是关宁军中有本事能打仗的，倒是可以大用，孙元自然也将这个建议写了上去。

崇祯十三年三月。皇太极终于决定出兵，他任命济尔哈朗为右翼主帅，多铎为左翼军主帅，威胁锦州。他指定的战略是先取锦州，再破山海关，进而为将来入关做准备。

六月，清兵围锦州。

洪承畴率大军久远，在黄土台和建奴激