在各个环太平洋城市。

最后，人类在无计可施之下，提取地球最强生物哥斯拉的基因，利用哥斯拉的基因制造出了生物机甲“贼鸥”，来对抗开菊兽大军。

由两名脑部神经网络互相串连的操纵者同步操作生物机甲，利用仪器来检测开菊兽的级别与代号。

自从有了生物机甲，人类开始获得胜利，甚至将开菊兽袭击变成宣传活动与仪式，但人类却并不知道更加恐怖的威胁即将来临，而地球保卫战也就此打响。