就像其他的真神教会一样，正义教会也同样拥有一段黑历史，只不过那一段黑历史的时间很短暂，只有不到十年的时间，在之后正义教会为了能够掩盖这一段黑历史，甚至不惜假借圣战为名，将好几个参与到这段黑历史、有着详细资料和证据的真神教会给摧毁和吞并了，而民间所有与此有关的资料也都尽可能的销毁。

不过，即便正义教会再怎么尽力销毁和这段黑历史有关的资料，依然还是会出现一些漏网之鱼，而学术之城的禁书