策规划司、体制改革司、综合计划司、经济协调司（民国配套办公室)、财务司、科技质量司、系统工程一司（国家航空局)、系统工程二司（国家能源管理办公室)、系统工程三司（船舶行业管理办公室)。安全生产监督管理局（民爆器材监督管理局)、安全保密局、国际合作司、人事教育司、机关服务局等十七个司局级单位。

按照程功确立的国防科工委的职能职权职责，内阁和十大部委的绝大多数权利都被剥离出来，东辉内阁只保留