多次招安下，郑芝龙决定放弃海盗生涯，转而成为朝廷水师的一名游击将军。

他这样做的原意是让自己和手下都洗白，成为能吃官粮的正式水师，结果没想到自己手下的那些人中，有许多做惯了海盗，认为郑芝龙投靠朝廷就是背叛，结果连十八芝的兄弟都有不少离开了他继续当海盗，许多手下也四散而去了。

这个时候，正是郑芝龙最困难的时期，朝廷见到郑芝龙实力消去大半，颇有些不重视他，手下又因为失去信心而大部分