出于战争形势和实际战斗指挥需要，周士相决定组建军一级编制。根据他的要求，军部将从现有各镇中选出10个镇的精锐合编为5个军。每军下辖两镇，一个为纯火器镇，一个为步骑合编镇。各军实际定编战斗人员21000人，非战斗人员（后勤、参谋）2000。

新组建的军编制取消卫一级，由伍、队、营、团、旅、镇六级构成。

一军之将称为军长，以下为镇将、旅校、团长、营官、队正、伍长。军长为都指