番荆襄战事，又加以洪水的影响，很可能导致疫病蔓延盛于往年，故而得报病例之后，军府不敢有半点轻忽。应对疫病的方法，这些年来各级官署都已经有了成例：

除了立即调动人手，加快收拾填埋战场上的尸身以外；再遍传号令，要求境内的百姓尽一切可能饮用熟水，日常多洗澡洗手，室内开窗通风；各处的驻军也都立即停止调动，尽量减少将士外出；还封锁了多条商路。

同时，军府与州府又向各地征调医官，提前预备药