沙也加身亡，兜甲儿发狂，驾驶魔神凯撒暴走，并且转变为毁灭一切的魔神·魔神ZERO，开始真正的暴走。

而原本能够对抗魔神凯撒的真·盖塔因为流龙马憋屈的死在监狱中，导致真·盖塔战斗力大不如前，神隼人更是因为流龙马的死，带着盖塔队前往了宇宙。

多蒙更是因为深村玲的死，万念俱灰，带着他和深村玲那个没有在TV与《超级机器人大战》中出现过的女儿前往宇宙，遵循深村玲的遗愿，对抗外星入侵者。