黑暗区域，是存在于数码世界最底层的一个歪斜扭曲的空间，也可以说是数码宝贝们的墓地。

大部分数码宝贝死亡之后，会在创始村变成数码蛋，重新赋予新的生命。只不过，因为原本的记忆数据等资料消散，所以会像一个新生婴儿一样。除了某些生前实力非常强大的存在，可能会保留一些记忆碎片。

而某些邪恶的数码宝贝则会因为各种身上的黑暗力量，死亡后不能消除就会被送往黑暗区